- Έρευνα -σε συνεργασία με τα Ινστιτούτα του ΕΛ.ΚΕ.Θ.Ε.- που καλύπτει ολόκληρο το φάσμα της ωκεανογραφικής επιστήμης στο Αιγαίο και τη Μεσόγειο Θάλασσα.
- Συνεργασία με ελληνικά και διεθνή ερευνητικά ιδρύματα, Ενυδρεία, Μουσεία Φυσικής Ιστορίας με σκοπό την ανταλλαγή πρακτικών και τεχνογνωσίας σε θέματα επιστημονικής έρευνας αλλά και λειτουργίας και βελτίωσης των εγκαταστάσεων των ενυδρείων και των εκθεσιακών χώρων.
- Μελέτη απειλουμένων ειδών, όπως θαλάσσιων χελωνών, θαλάσσιων θηλαστικών που περιλαμβάνονται στη διεθνή σύμβαση CITES.
- Μελέτη και επιστημονική παρακολούθηση ξενικών θαλάσσιων ειδών τα οποία εισέρχονται στη Μεσόγειο από την Ερυθρά Θάλασσα μέσω της διώρυγας του Σουέζ (Λεσσεψιανοί μετανάστες).
- Μελέτη και προστασία του ενδημικού και ψαριού του γλυκού νερού «Γκιζάνι» (Ladigesocypris ghigii)